医疗器械经营许可证办理流程大致如下：

1.资料整理与递交，需具备以下资料：《医疗器械经营企业许可证申请表》；《企业名称预先核准通知书》；申请报告；经营场地、仓库场所的证明文件；经营场所、仓库布局平面图；拟办法定负责人、企业负责人、质量管理人的身份证、学历证明或职称证明的复印件及个人简历；技术人员一览表及学历、职称证书复印件；经营质量管理规范文件目录；企业已安装的产品购、销、存的信息管理系统；仓储设施设备目录、质量管理人员在岗自我保证声明；申请《医疗器械经营企业许可证》确认书

2.材料审批：对申请人申办医疗器械经营许可证的材料进行审批，作出受理或不予受理决定。